Na ostrove často prší hlavne v zime a teploty sa približujú k 15 stupňom. Vďaka tomu, a tiež aj zásluhou spodných vôd má príroda dostatok vlahy po celý rok. Lefkada má typické subtropické podnebie. Priemerné letné teploty vzduchu sú 27 stupňov a v tomto období zasa takmer vôbec neprší. Teplota morskej vody sa v sezóne drží na príjemných 23 stupňoch.